Biểu dương và đánh giá cao những nỗ lực, kết quả đạt được của Tổng cục trong năm qua,  Bộ trưởng Bộ TN&MT Nguyễn Minh Quang nhấn mạnh, năm 2013, năm bản lề có ý nghĩa đặc biệt quan trọng đối với việc hoàn thành các mục tiêu giai đoạn 2011 - 2015, trong bối cảnh đất nước còn nhiều khó khăn, Tổng cục cần quyết tâm, chung sức, chung lòng đưa công tác BVMT có những bước phát triển hơn về chất, tạo động lực thúc đẩy mạnh mẽ đạt được các mục tiêu về BVMT đến năm 2015 mà Chiến lược quốc gia về BVMT đã đề ra.

Để đạt những mục tiêu của Chiến lược, Bộ trưởng đề nghị, Tổng cục tập trung cao độ vào việc nghiên cứu, sửa đổi Luật BVMT, khắc phục ngay những hạn chế, bất cập trong hệ thống phát luật về BVMT; gấp rút hoàn thành Nghị quyết về một số vấn đề cấp bách trong lĩnh vực BVMT để trình Chính phủ trong tháng 1/2013; đẩy mạnh công tác thanh tra, kiểm tra, huy động tổng hợp sức mạnh của các đơn vị tránh sự phân tán, manh mún, chồng chéo; chú trọng nâng cao chất lượng báo cáo đánh giá tác động  môi trường, tăng cường hậu kiểm, khắc phục tình trạng hình thức trong việc lập và thực hiện báo cáo đánh giá tác động môi trường (ĐTM).

Báo cáo tổng kết năm 2012 cho thấy, Tổng cục hoàn thành, kiểm tra đối với 429 cơ sở, KCN, CCN; xử lý và đề nghị xử lý đối với 157 cơ sở vi phạm với số tiền xử phạt là 32,7 tỷ đồng. Cũng trong thời gian này, Tổng cục lập 5 đoàn thanh, kiểm tra về BVMT theo Quyết định 64/CP  đối với 38 cơ sở gây ô gây ô nhiễm môi trường nghiêm trọng trên phạm vi 11 tỉnh, thành phố trực thuộc TƯ, đoàn đã lập 31 biên bản vi phạm hành chính đối với 31 cơ sở có hành vi vi phạm pháp luật về BVMT, chuyển hồ sơ cho Chánh Thanh tra Bộ ra quyết định xử phạt với số tiền 1.861 triệu đồng.

Theo Phó Tổng Cục trưởng Nguyễn Thế Đồng, năm 2013, Tổng cục sẽ tập trung thanh, kiểm tra việc chấp hành các quy định của pháp luật về BVMT đối với các cơ sở hành nghề quản lý chất thải nguy hại; các dự án cơ sở xản xuất, kinh doanh, dịch vụ thuộc trách nhiệm của Bộ, các cơ sở, KCN, CCN gây ô nhiễm các lưu vực sông; các cơ sở khai thác, chế biến và tàng trữ dầu khí; các cơ sở sản xuất giấy và bột giấy thuộc đối tượng phải lập báo cáo ĐTM; thắt chặt quản lý nhập khẩu, quá cảnh và lưu giữ phế liệu, chất thải tại các cảng biển.